Les TeloHAEC, un modèle endothélial prometteur pour l’étude de variations génétiques

Abstract

L’athérosclérose est une maladie polygénique dont l’impact du niveau des lipoprotéines a été mis à l’avant-plan au détriment de la composante inflammatoire de la maladie. Le rôle des cellules endothéliales demeure sous exploré dans ce contexte et le rôle d’un grand nombre de variations génétiques associées à cette maladie demeure inconnu. Afin d’étudier ces variations génétiques dans un modèle endothélial plus permissif aux protocoles d’édition génétique, nous entreprenons de comparer la réponse transcriptionnelle et les régions ouvertes de la chromatine entre un modèle primaire, les « human coronary artery endothelial cells » (HCAEC) et un modèle immortalisé, les « human aortic endothelial cells » surexprimant la télomérase (TeloHAEC). Nous posons l’hypothèse que la réponse aux molécules pro-inflammatoires TNF-α, IL-1β, IL-6 et oxLDL est analogue chez les TeloHAEC et HCAEC. Le premier objectif de ce projet a été d’optimiser la réponse des HCAEC à ces différents stimuli. Par qPCR, l’expression des molécules d’adhésions (CAMs) a été évaluée. Tel qu’attendu, le TNF-α et l’IL-1β provoquent une forte augmentation de l’expression des CAMs, cependant leur induction avec le oxLDL et l’IL6 est faible selon les conditions testées. Ensuite, nous avons comparé le transcriptome et l’euchromatine par une analyse de voie métabolique avec l’outil DAVID et une analyse PCA des données RNAseq et ATACseq. Nos résultats indiquent que les voies métaboliques induites par le TNF-α sont analogues pour les 2 types cellulaires ainsi que leur distribution de la variance entre échantillons pour le traitement. Toutefois, la composante principale demeure le type cellulaire. Globalement, ces résultats préliminaires sont prometteurs quant à l’utilité des TeloHAEC comme modèle endothélial. Cependant, l’optimisation des protocoles pour l’induction au oxLDL et IL-6, ainsi que le séquençage des librairies IL-1β, IL-6 et oxLDL reste à accomplir afin d’avoir une vue plus représentative de leur réponse inflammatoire.