RNAseq

Major cell-types in multiomic single-nucleus datasets impact statistical modeling of links between regulatory sequences and target genes

- Epigenomic profiling, including ATACseq, is one of the main tools used to define enhancers. Because enhancers are overwhelmingly cell-type specific, inference of their activity is greatly limited in complex tissues. Multiomic assays that probe in …

L’apprentissage machine pour la prédiction de peptides immunogènes à partir de RNAseq de tumeur

Plusieurs stratégies sont présentement explorées afin de conditionner le système immunitaire à reconnaître les cellules tumorales. Cependant, la majorité de ces efforts concentrés sur l’exome, ne permettent pas d’induire une réponse immunologique …